Die Organe des Vereins sind der Vorstand und das Kuratorium.
Im fünfköpfige Vorstand sind universitätsexterne Personen mit besonderer Berufserfahrung und zugleich Verbindung zur Universität – meist Absolventen – vertreten. Außerdem ist der jeweilige Rektor festes Mitglied dieses Gremiums und sichert dadurch den direkten Bezug zur Universität. Der Vorstand wird satzungsgemäß alle zwei Jahre neu gewählt.
Die letzte Wahl fand am 08. Juli 2024 statt.
Prof. Dr. Carl-Heinrich Esser
Josef Zimmermann hat die Universität mit seinem langjährigen und außerordentlichen Engagement unglaublich bereichert. Auch wenn ich bedauere, dass er das Amt als Vorsitzender der Freunde abgibt, habe ich Verständnis dafür und freue mich umso mehr, dass uns seine Erfahrung und sein Einsatz in der Stiftung weiter erhalten bleiben.