Seit September 2007 ist Michael Woywode Direktor des Instituts für Mittelstandsforschung (ifm) sowie Inhaber des Lehrstuhls für Mittelstandsforschung und Entrepreneurship an der Universität Mannheim. Seine wissenschaftlichen Arbeiten sind in hochrangigen wirtschaftswissenschaftlichen Journalen wie dem Academy of Management Journal, Organization Studies, oder dem American Journal of Sociology erschienen. Namhafte Stiftungen wie die Volkswagen Stiftung, die Alexander von Humboldt Stiftung oder die Deutsche Forschungsgemeinschaft haben seine bisherigen Forschungsvorhaben finanziell unterstützt.
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